Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR1Q2NL82 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms