Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HADHQ16836 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HADHQ16836 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HADHQ16836 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HADHQ16836 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HADHQ16836 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HADHQ16836 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HADHQ16836 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HADHQ16836 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HADHQ16836 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HADHQ16836 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HADHQ16836 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HADHQ16836 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HADHQ16836 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HADHQ16836 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HADHQ16836 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HADHQ16836 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HADHQ16836 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HADHQ16836 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HADHQ16836 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HADHQ16836 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HADHQ16836 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HADHQ16836 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HADHQ16836 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HADHQ16836 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HADHQ16836 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HADHQ16836 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HADHQ16836 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HADHQ16836 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HADHQ16836 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HADHQ16836 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHQ16836 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHQ16836 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHQ16836 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHQ16836 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHQ16836 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHQ16836 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHQ16836 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHQ16836 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHQ16836 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHQ16836 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHQ16836 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHQ16836 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHQ16836 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHQ16836 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHQ16836 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHQ16836 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHQ16836 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHQ16836 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHQ16836 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHQ16836 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHQ16836 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHQ16836 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHQ16836 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHQ16836 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHQ16836 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHQ16836 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHQ16836 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHQ16836 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHQ16836 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHQ16836 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHQ16836 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHQ16836 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHQ16836 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHQ16836 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHQ16836 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHQ16836 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHQ16836 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHQ16836 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHQ16836 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHQ16836 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHQ16836 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHQ16836 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHQ16836 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHQ16836 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHQ16836 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHQ16836 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHQ16836 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHQ16836 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHQ16836 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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