Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGISQ16647 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGISQ16647 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms