Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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CTF1Q16619 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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CTF1Q16619 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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CTF1Q16619 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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CTF1Q16619 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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CTF1Q16619 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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CTF1Q16619 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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CTF1Q16619 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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CTF1Q16619 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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