Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN9AQ15858 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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