Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC85BQ15834 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
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