Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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