Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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