Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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