Protein–RNA interactions for Protein: Q14CS0

UBXN2B, UBX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2BQ14CS0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN2BQ14CS0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN2BQ14CS0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN2BQ14CS0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN2BQ14CS0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN2BQ14CS0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN2BQ14CS0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN2BQ14CS0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN2BQ14CS0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms