Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1BQ14684 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP1BQ14684 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RRP1BQ14684 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RRP1BQ14684 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
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