Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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IRF3Q14653 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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IRF3Q14653 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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IRF3Q14653 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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IRF3Q14653 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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IRF3Q14653 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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IRF3Q14653 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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