Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOFQ13790 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
APOFQ13790 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOFQ13790 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOFQ13790 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
APOFQ13790 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
APOFQ13790 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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