Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA4Q13772 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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