Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALKBH1Q13686 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH1Q13686 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms