Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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