Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
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