Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
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