Protein–RNA interactions for Protein: Q13530

SERINC3, Serine incorporator 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC3Q13530 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC3Q13530 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC3Q13530 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC3Q13530 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC3Q13530 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC3Q13530 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC3Q13530 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC3Q13530 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC3Q13530 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC3Q13530 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC3Q13530 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERINC3Q13530 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERINC3Q13530 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERINC3Q13530 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms