Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
XRCC4Q13426 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
XRCC4Q13426 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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