Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE3BQ13370 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
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