Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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ERCC8Q13216 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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ERCC8Q13216 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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ERCC8Q13216 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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ERCC8Q13216 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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ERCC8Q13216 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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ERCC8Q13216 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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ERCC8Q13216 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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ERCC8Q13216 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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