Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLFQ13129 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLFQ13129 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLFQ13129 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RLFQ13129 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLFQ13129 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLFQ13129 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RLFQ13129 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RLFQ13129 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLFQ13129 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLFQ13129 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLFQ13129 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLFQ13129 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLFQ13129 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLFQ13129 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLFQ13129 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLFQ13129 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLFQ13129 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLFQ13129 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLFQ13129 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLFQ13129 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLFQ13129 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLFQ13129 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLFQ13129 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLFQ13129 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLFQ13129 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RLFQ13129 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLFQ13129 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLFQ13129 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLFQ13129 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLFQ13129 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLFQ13129 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLFQ13129 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLFQ13129 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RLFQ13129 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLFQ13129 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLFQ13129 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLFQ13129 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLFQ13129 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLFQ13129 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLFQ13129 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RLFQ13129 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RLFQ13129 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RLFQ13129 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RLFQ13129 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RLFQ13129 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLFQ13129 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLFQ13129 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLFQ13129 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLFQ13129 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLFQ13129 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLFQ13129 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLFQ13129 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLFQ13129 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLFQ13129 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLFQ13129 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLFQ13129 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLFQ13129 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLFQ13129 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLFQ13129 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLFQ13129 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLFQ13129 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLFQ13129 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLFQ13129 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLFQ13129 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLFQ13129 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLFQ13129 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms