Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP4Q13115 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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