Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN3Q13064 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
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