Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDNQ13061 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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