Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM32Q13049 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM32Q13049 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms