Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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