Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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