Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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