Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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