Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TFCP2Q12800 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2Q12800 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2Q12800 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2Q12800 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2Q12800 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2Q12800 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2Q12800 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2Q12800 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2Q12800 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2Q12800 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2Q12800 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFCP2Q12800 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms