Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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KCNMA1Q12791 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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KCNMA1Q12791 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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KCNMA1Q12791 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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