Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 NSA1YGL111W 1392 nt3.24□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 RIM13YMR154C 2184 nt3.24□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 NSP1YJL041W 2472 nt3.24□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YCR013CYCR013C 648 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 SRD1YCR018C 666 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YDR431WYDR431W 312 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 RSM28YDR494W 1086 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 HLR1YDR528W 1272 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 NSA2YER126C 786 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 AIM19YIL087C 474 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YJL169WYJL169W 369 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 AIM26YKL037W 357 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 RPC37YKR025W 849 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 RPL22AYLR061W 366 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YAR070CYAR070C 300 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 SSN8YNL025C 972 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 BNI4YNL233W 2679 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.23□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 LCB4YOR171C 1875 nt3.22□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 FAP7YDL166C 594 nt3.22□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YFR054CYFR054C 579 nt3.22□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 THG1YGR024C 714 nt3.22□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YGR226CYGR226C 210 nt3.22□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 EFG1YGR271C-A 702 nt3.22□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 RNR2YJL026W 1200 nt3.22□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YKL123WYKL123W 381 nt3.22□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 TVP18YMR071C 504 nt3.22□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 IMP4YNL075W 873 nt3.22□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 ADF1YCL058W-A 342 nt3.22□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 NOP12YOL041C 1380 nt3.22□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 REF2YDR195W 1602 nt3.22□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 SLK19YOR195W 2466 nt3.21□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 HFD1YMR110C 1599 nt3.21□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 HOP1YIL072W 1818 nt3.21□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 UBP8YMR223W 1416 nt3.21□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 BRE5YNR051C 1548 nt3.21□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 CHS3YBR023C 3498 nt3.21□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 RRP5YMR229C 5190 nt3.21□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 EMI1YDR512C 564 nt3.21□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 VEL1YGL258W 621 nt3.21□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YLR076CYLR076C 423 nt3.21□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 ARC18YLR370C 537 nt3.21□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 RAD33YML011C 534 nt3.21□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YOR277CYOR277C 309 nt3.21□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 AIM4YBR194W 372 nt3.21□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 SEA4YBL104C 3117 nt3.21□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 AKR1YDR264C 2295 nt3.21□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 PEX1YKL197C 3132 nt3.2□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.2□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 UBC5YDR059C 447 nt3.2□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YDR262WYDR262W 819 nt3.2□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 SAE2YGL175C 1038 nt3.2□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 Q0144Q0144 330 nt3.2□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 SDS22YKL193C 1017 nt3.2□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YNR025CYNR025C 360 nt3.2□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 SUS1YBR111W-A 291 nt3.2□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 SLF1YDR515W 1344 nt3.19□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 AUS1YOR011W 4185 nt3.19□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 SMC3YJL074C 3693 nt3.19□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 RSM24YDR175C 960 nt3.19□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 AIM18YHR198C 966 nt3.19□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 LSM8YJR022W 330 nt3.19□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.19□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 PAI3YMR174C 207 nt3.19□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 MRPL40YPL173W 894 nt3.19□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YCL007CYCL007C 393 nt3.19□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 LST4YKL176C 2487 nt3.19□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 STU2YLR045C 2667 nt3.19□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 FLO5YHR211W 3228 nt3.19□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 SHQ1YIL104C 1524 nt3.19□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 PSF1YDR013W 627 nt3.18□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 STE14YDR410C 720 nt3.18□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 RSM18YER050C 417 nt3.18□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt3.18□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 ENV10YLR065C 546 nt3.18□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 OST6YML019W 999 nt3.18□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YNL013CYNL013C 378 nt3.18□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 ATX1YNL259C 222 nt3.18□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 MSR1YHR091C 1932 nt3.18□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 NOP4YPL043W 2058 nt3.18□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 KHA1YJL094C 2622 nt3.18□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 CBP2YHL038C 1893 nt3.18□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 EAP1YKL204W 1899 nt3.18□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 MET5YJR137C 4329 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 BMS1YPL217C 3552 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 EPL1YFL024C 2499 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 ATP22YDR350C 2055 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 CDC26YFR036W 375 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt3.17□□□□□ -1.9
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