Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms