Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms