Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GOLGA3Q08378 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms