Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms