Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBQ06643 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBQ06643 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBQ06643 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBQ06643 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBQ06643 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBQ06643 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBQ06643 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBQ06643 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBQ06643 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBQ06643 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBQ06643 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBQ06643 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBQ06643 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBQ06643 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBQ06643 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBQ06643 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBQ06643 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBQ06643 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBQ06643 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBQ06643 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBQ06643 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBQ06643 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBQ06643 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBQ06643 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBQ06643 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBQ06643 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBQ06643 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBQ06643 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBQ06643 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBQ06643 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBQ06643 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBQ06643 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBQ06643 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBQ06643 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBQ06643 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBQ06643 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBQ06643 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBQ06643 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBQ06643 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBQ06643 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBQ06643 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBQ06643 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBQ06643 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBQ06643 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBQ06643 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBQ06643 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBQ06643 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBQ06643 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBQ06643 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBQ06643 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBQ06643 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBQ06643 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBQ06643 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBQ06643 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBQ06643 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBQ06643 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBQ06643 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms