Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 PDR10YOR328W 4695 nt5□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 THI21YPL258C 1656 nt4.99□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YGR053CYGR053C 852 nt4.99□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 TEN1YLR010C 483 nt4.99□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YLR346CYLR346C 306 nt4.99□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 PHO88YBR106W 567 nt4.99□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 SIP1YDR422C 2448 nt4.99□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 SCY1YGL083W 2415 nt4.99□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 ATM1YMR301C 2073 nt4.99□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YJR003CYJR003C 1560 nt4.99□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 HUL5YGL141W 2733 nt4.98□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 PEP7YDR323C 1548 nt4.98□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 MDM36YPR083W 1740 nt4.98□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YER187WYER187W 426 nt4.98□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 MIC19YFR011C 513 nt4.98□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YHL026CYHL026C 948 nt4.98□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 ZEO1YOL109W 342 nt4.98□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 RPC40YPR110C 1008 nt4.98□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 RSC6YCR052W 1452 nt4.98□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 AVT7YIL088C 1473 nt4.98□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 CBF5YLR175W 1452 nt4.98□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 STI1YOR027W 1770 nt4.98□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 SRS2YJL092W 3525 nt4.98□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 STE5YDR103W 2754 nt4.98□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 OSH6YKR003W 1347 nt4.97□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 TPA1YER049W 1935 nt4.97□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 NDC1YML031W 1968 nt4.97□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YDL068WYDL068W 330 nt4.97□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 OPI6YDL096C 327 nt4.97□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YDR102CYDR102C 333 nt4.97□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YER038W-AYER038W-A 381 nt4.97□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 ATX1YNL259C 222 nt4.97□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YBR016WYBR016W 387 nt4.97□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 MET31YPL038W 534 nt4.97□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 SEC39YLR440C 2130 nt4.97□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YGR117CYGR117C 1431 nt4.97□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.97□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 AFT1YGL071W 2073 nt4.96□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt4.96□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YIR014WYIR014W 729 nt4.96□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 HHT2YNL031C 411 nt4.96□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt4.96□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 MRPL50YNR022C 420 nt4.96□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 PPG1YNR032W 1107 nt4.96□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YPL062WYPL062W 405 nt4.96□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 RRD2YPL152W 1077 nt4.96□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 TAF12YDR145W 1620 nt4.96□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 ROT2YBR229C 2865 nt4.96□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 RAD52YML032C 1416 nt4.96□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 HUL4YJR036C 2679 nt4.95□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 ARF2YDL137W 546 nt4.95□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 RPL28YGL103W 450 nt4.95□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt4.95□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 INO4YOL108C 456 nt4.95□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 STE7YDL159W 1548 nt4.95□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 BRE5YNR051C 1548 nt4.95□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 MSH1YHR120W 2880 nt4.95□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 PTR3YFR029W 2037 nt4.94□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YDL199CYDL199C 2064 nt4.94□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 ROY1YMR258C 1662 nt4.94□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.94□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 RAD14YMR201C 1116 nt4.94□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 IMP4YNL075W 873 nt4.94□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YJL132WYJL132W 2253 nt4.94□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YOL153CYOL153C 1746 nt4.94□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 SYF1YDR416W 2580 nt4.94□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 GRS1YBR121C 2004 nt4.94□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YRR1YOR162C 2433 nt4.93□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 RPL11BYGR085C 525 nt4.93□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.93□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 UBC7YMR022W 498 nt4.93□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt4.93□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YOR082CYOR082C 342 nt4.93□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 RPL11AYPR102C 525 nt4.93□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 HRR25YPL204W 1485 nt4.93□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 DSF2YBR007C 2211 nt4.92□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 VBA2YBR293W 1425 nt4.92□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YDR134CYDR134C 411 nt4.92□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YDR340WYDR340W 303 nt4.92□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 RPL1BYGL135W 654 nt4.92□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 RNR4YGR180C 1038 nt4.92□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 RPP0YLR340W 939 nt4.92□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.92□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt4.92□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 RPL1AYPL220W 654 nt4.92□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt4.92□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 SNF3YDL194W 2655 nt4.92□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 KEX1YGL203C 2190 nt4.92□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 RIM13YMR154C 2184 nt4.92□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 HPC2YBR215W 1878 nt4.92□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 PRP3YDR473C 1410 nt4.91□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YGR265WYGR265W 411 nt4.91□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 MRPL20YKR085C 588 nt4.91□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 YLR031WYLR031W 561 nt4.91□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 HCH1YNL281W 462 nt4.91□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 TIM18YOR297C 579 nt4.91□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 snR36snR36 182 nt4.91□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 DPB3YBR278W 606 nt4.91□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 PUT2YHR037W 1728 nt4.91□□□□□ -1.62
HDA3Q06623 NUG1YER006W 1563 nt4.91□□□□□ -1.62
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