Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms