Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms