Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 RPS21AYKR057W 264 nt3.07□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 YLR050CYLR050C 486 nt3.07□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 APC9YLR102C 798 nt3.07□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 BRX1YOL077C 876 nt3.07□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 YOR387CYOR387C 621 nt3.07□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3.07□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 snR42snR42 351 nt3.07□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 CHO2YGR157W 2610 nt3.07□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.07□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 RAD18YCR066W 1464 nt3.07□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 PIN4YBL051C 2007 nt3.07□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 STT4YLR305C 5703 nt3.06□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 TVP15YDR100W 432 nt3.06□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 YDR248CYDR248C 582 nt3.06□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 EFG1YGR271C-A 702 nt3.06□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt3.06□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 YJL049WYJL049W 1353 nt3.06□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 SDO1YLR022C 753 nt3.06□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 ITT1YML068W 1395 nt3.06□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 YSF3YNL138W-A 258 nt3.06□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 DUF1YOL087C 3351 nt3.06□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 CAT5YOR125C 702 nt3.06□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 REC8YPR007C 2043 nt3.05□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 TFB2YPL122C 1542 nt3.05□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 CRD1YDL142C 852 nt3.05□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 HMO1YDR174W 741 nt3.05□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 YGL109WYGL109W 324 nt3.05□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 RPL27AYHR010W 411 nt3.05□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 CFD1YIL003W 882 nt3.05□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 MCT1YOR221C 1083 nt3.05□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 RPA43YOR340C 981 nt3.05□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 MUD1YBR119W 897 nt3.05□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 REG1YDR028C 3045 nt3.05□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 AGE1YDR524C 1449 nt3.04□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 YTA7YGR270W 4140 nt3.04□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 RRP42YDL111C 798 nt3.04□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 DTD1YDL219W 453 nt3.04□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 EPT1YHR123W 1176 nt3.04□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 SNX4YJL036W 1272 nt3.04□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 RSM19YNR037C 276 nt3.04□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 SGT1YOR057W 1188 nt3.04□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 POL30YBR088C 777 nt3.04□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 YCL002CYCL002C 792 nt3.04□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 HUL5YGL141W 2733 nt3.04□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 NFT1YKR103W 3657 nt3.04□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 MET10YFR030W 3108 nt3.04□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 RIM1YCR028C-A 408 nt3.03□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 ERP3YDL018C 678 nt3.03□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 RAV2YDR202C 1056 nt3.03□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.03□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.03□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 SEC4YFL005W 648 nt3.03□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 MIG2YGL209W 1149 nt3.03□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 YGR226CYGR226C 210 nt3.03□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 QCR10YHR001W-A 234 nt3.03□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 LIN1YHR156C 1023 nt3.03□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 CKA1YIL035C 1119 nt3.03□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 ATG38YLR211C 681 nt3.03□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 YMR187CYMR187C 1296 nt3.03□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 YNR062CYNR062C 984 nt3.03□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 TIM12YBR091C 330 nt3.03□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 SRB8YCR081W 4284 nt3.03□□□□□ -1.92
RRN11Q04712 BUD4YJR092W 4344 nt3.02□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 CTF13YMR094W 1437 nt3.02□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 NGG1YDR176W 2109 nt3.02□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 TAF2YCR042C 4224 nt3.02□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 SHE9YDR393W 1371 nt3.02□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 SLY41YOR307C 1362 nt3.02□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt3.02□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 PIG2YIL045W 1617 nt3.02□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 MND1YGL183C 660 nt3.02□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 EMC4YGL231C 573 nt3.02□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.02□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.02□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 MIC27YNL100W 705 nt3.02□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 KAR4YCL055W 1008 nt3.02□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 NOP56YLR197W 1515 nt3.02□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 JIP5YPR169W 1479 nt3.02□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 VPS3YDR495C 3036 nt3.01□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 BNA4YBL098W 1383 nt3.01□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 YSP2YDR326C 4317 nt3.01□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 POL2YNL262W 6669 nt3.01□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 ESA1YOR244W 1338 nt3.01□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 THO1YER063W 657 nt3.01□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 YFL015CYFL015C 495 nt3.01□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 YGR107WYGR107W 450 nt3.01□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 YJL175WYJL175W 513 nt3.01□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 ATG27YJL178C 816 nt3.01□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 YKR011CYKR011C 1062 nt3.01□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 PRM6YML047C 1059 nt3.01□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 YMR087WYMR087W 855 nt3.01□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 RXT2YBR095C 1293 nt3.01□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 ITC1YGL133W 3795 nt3.01□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 SIZ1YDR409W 2715 nt3.01□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 SRC1YML034W 2505 nt3□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 MSH2YOL090W 2895 nt3□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 TGL3YMR313C 1929 nt3□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 LOC1YFR001W 615 nt3□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 GOS1YHL031C 672 nt3□□□□□ -1.93
RRN11Q04712 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3□□□□□ -1.93
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