Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC3AQ02505 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC3AQ02505 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC3AQ02505 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC3AQ02505 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC3AQ02505 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC3AQ02505 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC3AQ02505 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC3AQ02505 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC3AQ02505 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MUC3AQ02505 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms