Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK17Q00537 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms