Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED6P86452 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms