Protein–RNA interactions for Protein: P84103

SRSF3, Serine/arginine-rich splicing factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF3P84103 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF3P84103 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms