Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL7P80098 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL7P80098 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL7P80098 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL7P80098 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL7P80098 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL7P80098 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL7P80098 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL7P80098 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL7P80098 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL7P80098 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL7P80098 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL7P80098 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL7P80098 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL7P80098 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL7P80098 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL7P80098 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL7P80098 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL7P80098 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL7P80098 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL7P80098 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL7P80098 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL7P80098 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL7P80098 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL7P80098 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL7P80098 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL7P80098 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL7P80098 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL7P80098 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL7P80098 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL7P80098 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL7P80098 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL7P80098 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL7P80098 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL7P80098 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL7P80098 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL7P80098 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL7P80098 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL7P80098 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL7P80098 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL7P80098 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL7P80098 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL7P80098 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL7P80098 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL7P80098 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL7P80098 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL7P80098 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL7P80098 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL7P80098 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL7P80098 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL7P80098 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL7P80098 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL7P80098 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL7P80098 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL7P80098 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL7P80098 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL7P80098 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL7P80098 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms