Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM193AP78312 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM193AP78312 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms