Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL30P62888 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL30P62888 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPL30P62888 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL30P62888 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL30P62888 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL30P62888 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL30P62888 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL30P62888 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL30P62888 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms